Add README to all crates

crates/manifest/README.md

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+# manifest
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+Pod の宣言的設定を TOML マニフェストとして定義・パースするクレート。プロバイダ設定、ワーカー設定、ディレクトリスコープ制約を記述できる。
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+## 公開型
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+- `PodManifest` — Pod 設定全体（`from_toml()` でパース）
+- `PodMeta` — Pod メタデータ（名前）
+- `ProviderConfig` — LLM プロバイダ設定（種別、モデル、APIキー環境変数、ベースURL）
+- `ProviderKind` — プロバイダ種別（`Anthropic`, `Openai`, `Gemini`, `Ollama`）
+- `WorkerManifest` — ワーカー設定（システムプロンプト、max_tokens、temperature）
+- `ScopeConfig` — スコープ設定（ルートディレクトリ）
+- `Scope` — ディレクトリスコープの実行時チェック（`contains()` でパス包含判定）